La meilleure période pour se rendre à Pontarlier est en juillet et en août.
Sur l'année, la température moyenne varie beaucoup. Elle se situe autour de 10 °C.
C'est en février que les températures sont les plus basses, avec des minimales autour de -2 °C. Avec en moyenne 25 °C de température maximale, c'est en juillet que les températures sont les plus élevées.
On compte généralement 122 jours de précipitations chaque année à Pontarlier.
Septembre est le mois le moins pluvieux avec 76 mm et 8 jours de précipitations et Décembre le plus pluvieux avec jusqu'à 121 mm et 12 jours de précipitations.
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