La meilleure période pour se rendre à Mongomo est de janvier à avril et de juin à juillet.
Sur l'année, la température moyenne varie peu. Elle se situe autour de 24 °C.
C'est en août que les températures sont les plus basses, avec des minimales autour de 21 °C. Avec en moyenne 28 °C de température maximale, c'est en mars que les températures sont les plus élevées.
On compte généralement 301 jours de précipitations chaque année à Mongomo.
Janvier est le mois le moins pluvieux avec 148 mm et 23 jours de précipitations et Octobre le plus pluvieux avec jusqu'à 280 mm et 29 jours de précipitations.
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