La meilleure période pour se rendre à Bonaberi est en avril.
Sur l'année, la température moyenne varie peu. Elle se situe autour de 26 °C.
C'est en août que les températures sont les plus basses, avec des minimales autour de 24 °C. Avec en moyenne 29 °C de température maximale, c'est en mars et en avril que les températures sont les plus élevées.
On compte généralement 315 jours de précipitations chaque année à Bonaberi.
Février est le mois le moins pluvieux avec 150 mm et 22 jours de précipitations et Septembre le plus pluvieux avec jusqu'à 341 mm et 29 jours de précipitations.
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