La meilleure période pour se rendre à San Pedro de Atacama est de janvier à avril et de septembre à décembre.
Sur l'année, la température moyenne varie modérément. Elle se situe autour de 10 °C.
C'est en juin que les températures sont les plus basses, avec des minimales autour de -2 °C. Avec en moyenne 21 °C de température maximale, c'est en janvier que les températures sont les plus élevées.
On compte généralement 2 jours de précipitations chaque année à San Pedro de Atacama.
Novembre est le mois le moins pluvieux avec pratiquement aucune précipitation et Février le plus pluvieux avec jusqu'à 12 mm et 1 jours de précipitations.
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C’est le port de la Mer du Sud pour tous ceux qui naviguaient et qui naviguent encore entre les océans Atlantique et Pacifique - les Cap Horniers - et ceux qui embouquaient le Détroit de Magellan. Pour la marine à voile, c’était l’escale obligatoire et salutaire après le passage éreintant du Cap Horn, ou la pénible traversée du Détroit de Magellan - souvent après une navigation de près de trois mois depuis l’Europe.
