La meilleure période pour se rendre à Puerto Aysén est en février.
Sur l'année, la température moyenne varie modérément. Elle se situe autour de 7 °C.
C'est en août que les températures sont les plus basses, avec des minimales autour de 2 °C. Avec en moyenne 15 °C de température maximale, c'est en février que les températures sont les plus élevées.
On compte généralement 238 jours de précipitations chaque année à Puerto Aysén.
Février est le mois le moins pluvieux avec 185 mm et 15 jours de précipitations et Juin le plus pluvieux avec jusqu'à 384 mm et 21 jours de précipitations.
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C’est le port de la Mer du Sud pour tous ceux qui naviguaient et qui naviguent encore entre les océans Atlantique et Pacifique - les Cap Horniers - et ceux qui embouquaient le Détroit de Magellan. Pour la marine à voile, c’était l’escale obligatoire et salutaire après le passage éreintant du Cap Horn, ou la pénible traversée du Détroit de Magellan - souvent après une navigation de près de trois mois depuis l’Europe.
