La meilleure période pour se rendre au Comarca Guna Yala est de janvier à avril.
Sur l'année, la température moyenne varie peu. Elle se situe autour de 28 °C.
C'est en février et en novembre que les températures sont les plus basses, avec des minimales autour de 27 °C. Avec en moyenne 30 °C de température maximale, c'est en juin que les températures sont les plus élevées.
On compte généralement 269 jours de précipitations chaque année au Comarca Guna Yala.
Février est le mois le moins pluvieux avec 37 mm et 7 jours de précipitations et Novembre le plus pluvieux avec jusqu'à 343 mm et 28 jours de précipitations.
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D'après un rapport de l'agence de voyages de luxe Virtuoso, le Panama arrive en tête des destinations choisies par leur clientèle sur ce début de l'année : 107% de réservations par rapport à l'année dernière.
