La meilleure période pour se rendre en Zamora Chinchipe est d'août à décembre.
Sur l'année, la température moyenne varie peu. Elle se situe autour de 19 °C.
C'est en août que les températures sont les plus basses, avec des minimales autour de 15 °C. Avec en moyenne 25 °C de température maximale, c'est en novembre que les températures sont les plus élevées.
On compte généralement 178 jours de précipitations chaque année en Zamora Chinchipe.
Août est le mois le moins pluvieux avec 49 mm et 8 jours de précipitations et Mars le plus pluvieux avec jusqu'à 256 mm et 23 jours de précipitations.
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